Genetica Umana

CONTATTI

Tipologia: UOC – Unità Operativa Complessa

Responsabile: Dott. Domenico Coviello
Tel: 010 5636 3977

E-mail: domenicocoviello@gaslini.org

Segreteria:
Tel: 010 5636 3974
E-mail: geneticaumana@gaslini.org

Localizzazione:
Padiglione 3 – primo piano (Citogenetica prenatale, Citogenetica postnatale e molecolare, Array-CGH, DEB test, NIPT test, test molecolari malattie geniche vedere elenco Servizi).

Padiglione 16 – piano terra (Citogenetica ematoncologica)

INFORMAZIONI UTILI E PRENOTAZIONI

Sono previste tre diverse modalità di prenotazione degli esami in base dalla tipologia di esami da richiedere:

1) Per prenotazioni chiama il Contact Center Regionale al numero 010.5383400 (opzione 6)
Gli orari sono i seguenti: Dal Lunedì al Venerdì: dalle 08.00 alle 18.00.

per la prenotazione di:
– Cariotipo postnatale
– Screening per emoglobinopatie (per coppie seguite da ginecologi in percorsi preconcezionali)
– Fibrosi Cistica
– Delezione cromosoma Y
– Sindrome X Fragile e patologie associate a Premutazione (FXPOI-FXTAS)
– PAI

– Sindrome di Gilbert

– Sospetta Emocromatosi

– Pannelli NGS in silico tramite Esoma

2) E’ possibile contattare direttamente il laboratorio il martedì, mercoledì e giovedì dalle ore 8.00 alle ore 10.00 al numero 010 5636 3974

per la prenotazione del NIPT TEST (DNA fetale) – screening prenatale non invasivo su sangue materno per trisomia 13, 18 , 21 e sesso fetale

Il NIPT test può essere eseguito dalla 10^ settimana di gestazione.

Prima dell’esecuzione del prelievo di sangue la gestante deve aver eseguito un’ecografia per la valutazione della corretta epoca gestazionale.

Il NIPT test, con il Kit in uso presso il Laboratorio, NON può essere eseguito in caso di:

– gravidanze gemellari dizigoti o iniziate come tali,

– tumore pregresso nella madre,

– trapianto d’organo nella madre,

– terapia con cellule staminali allogeniche,

– immunoterapia, radioterapia o trasfusione eseguite dalla gestante entro i 3 mesi precedenti.

3) E’ possibile contattare direttamente la segreteria della UOC al numero 010/5636 3974 il Lunedì, il Mercoledì e il Venerdì dalle 8:30 alle 12:30

per la prenotazione dei seguenti servizi:

Test molecolari per:
– Acondroplasia
– Angioedema ereditario
– Brachidattilia – Sindrome di Robinow
– Canalopatie (S. QT lungo, Brugada) (NGS)
– Cardiomiopatie (NGS)
– Cardiomiopatia transtiretina dipendente
– Craniosinostosi sindromiche e isolate:
– Sindrome di Apert
– Sindrome di Crouzon
– Sindrome di Boston
– Sindrome di Pallister-Hall
– Sindrome di Pfeiffer
– Sindrome di Saethre-Chotzen
– Sindrome di Muenke
– DisplasiaTanatofora
– Displasia Campomelica
– Displasia Multipla Epifisaria (MED)
– Displasia Oculo-Dento-Digitale
– Disomia Uniparentale (cromosomi 6, 7, 14, 15)
– Emocromatosi
– Encefalopatie epilettiche (NGS)
– Epliessie miocloniche progressive (NGS):

Malattia di Lafora
Malattia di Unverricht-Lundborg
Galattosialidosi
Ceroidolipofuscinosi neuronali
Malattia di Gaucher

– Epilessia notturna del lobo frontale A.D. (NGS)
– Emicrania Emiplegica familiare (NGS)
– Favismo (G6PD molecolare)
– Febbre Mediterranea (NGS)
– Ipercolesterolemia (NGS)
– IPEX
– Ipocondroplasia
– Malattia di Alzheimer (PSEN1-PSEN2-APP)
– Malattia di Danon
– Malattia di Fabry
– Melanoma Uveale I e II livello
– Patologie dell’aorta, non sindromiche e sindromiche (S. di Marfan, S. di Ehlers- Danlos) (NGS)
– Pseudoacondroplasia
– QFPCR in diagnosi prenatale per le aneuploidie dei cromosomi 13,18, 21, X, Y e su materiale abortivo per le aneuploidie dei cromosomi 13,15, 16, 18,21, 22, X, Y
– Ricerca mutazioni recettore per gli androgeni (AR)
– Sferocitosi e alterazioni di membrana del globulo rosso (NGS).
– SIDS (NGS)
– Simpolidattilia
– Sindrome di Aarskog
– Sindrome di Angelman
– Sindrome BOR (gene EYA1)
– Sindrome di Greig
– Sindromi da Iperaccrescimento (NGS)
– Sindrome di Kallmann
– Sindrome di Ladd
– Sindrome di Langer/bassa statura idiopatica
– Sindrome di Leri-Weill
– Sindrome di Mowat Wilson
– Sindrome di Noonan
– Sindrome di Pendred
– Sindrome di Prader Willi
– Sindrome di Sotos
– Sindrome di Sotos Like
– Sindrome Tanatofora
– Sindrome di Wolff-Parkinson-White
– Sordità genetica non sindromica (connessine 26 e 30 e gene POU3F4)
– Tachicardia ventricolare polimorfa catecolaminergica (NGS)

Citogenetica e citogenetica molecolare:

– Array-CGH pre e postnatale
– Cariotipo ematoncologico
– Cariotipo prenatale
– FISH per caratterizzazione riarrangiamenti cromosomici
– FISH per Sindrome di Williams, Sindrome di Di George, Sindrome di Wolf-Hirschhorn
– Test al DEB per Anemia di Fanconi

Per quanto riguarda lo screening per emoglobinopatie prescritto da pediatri per bambini o da ginecologi per coppie in corso di gravidanza, l’accesso è diretto al Pad20 (Ospedale di giorno) senza prenotazione.

ATTIVITA’

Il Laboratorio di Genetica Umana effettua test genetici e genomici in epoca pre e postnatale nell’ambito del Sistema Sanitario Nazionale.

Le attività sono rivolte alla diagnosi di malattie genetiche rare e alla valutazione della componente genetica di malattie complesse e oncologiche.

Tali attività riguardano principalmente:

– Indagini di Citogenetica classica per diagnosi di anomalie cromosomiche costituzionali ed acquisite e di Citogenetica Molecolare per l’indagine di riarrangiamenti genomici (tramite Array CGH e FISH).
– Indagini di genetica molecolare sul DNA per numerose patologie tra cui: Cardiomiopatie e ipercolesterolemia, Encefalopatie epilettiche, Displasie scheletriche, Emocromatosi, Favismo, Febbre mediterranea, Fibrosi cistica, Malformazioni craniche, Sindrome di Gilbert, Sindromi correlate a deficit intellettivo, Sindromi da Iperaccrescimento e Ipoaccrescimento, Sterilità maschile, Sordità neurosensoriale, Trombosi, Melanoma Uveale.
– Indagini per screening (HPLC) e caratterizzazione molecolare (sequenziamento, MLPA, RDB, NGS) pre e postnatale di Emoglobinopatie.

La struttura si avvale di moderne apparecchiature per l’esecuzione di test genetici, inclusa la metodologia Next Generation Sequencing (NGS), e usufruisce dei più aggiornati software e database per la gestione dei test genetici.

Il Laboratorio partecipa a controlli di qualità europei (EMQN, CEQAS) e nazionali (Istituto Superiore di Sanità).

Dal 2008 la Struttura è certificata da Bureau Veritas e dalla Società Italiana di Genetica Umana (SIGU) attualmente per le norme UNI EN ISO 9001:2015 e SIGUCERT.

Le attività del laboratorio sono conformi alla normativa europea EU679/2016 sulla privacy.

SERVIZI

Consulenza pre-test e post-test

Agli utenti esterni che afferiscono alla Sala Medica del Laboratorio di Genetica Umana (padiglione

20 4°piano stanza 1) viene offerto un colloquio pre test (eseguito da biologi strutturati delLaboratorio ), che ha lo scopo di spiegare il significato ed il limite degli esami che eseguiranno, al termine del colloquio viene acquisito il consenso informato che deve essere sottoscritto dall’utente o, qualora non sia in condizione di esprimerlo, dai genitori o dal tutore.

Tale consenso informato deve essere rispondente ai requisiti di legge ed essere specifico per ogni tipologia di test genetico.

Colloquio Pre test prenatale per NIPT viene eseguito dai biologi strutturati che si occupano di citogenetica,
Colloquio Pre test genetici postnatali viene eseguita dai biologi strutturati del laboratorio.

Vengono date informazioni relative all’esame e vengono raccolti i dati necessari per una corretta interpretazione dei risultati, e fatto firmare il consenso informato. Tale consenso viene poi inserito nella cartella che segue il campione in laboratorio e conservato nella cartella del paziente.

I dati vengono raccolti su una cartella elettronica nel sistema aziendale Armonia secondo le seguenti modalità. L’utente deve sempre sapere che tipo di informazioni sono raccolte e per quale finalità.

3) Consulenza Post test quando nel referto si segnala che l’esito delle indagini eseguite presso il nostro Laboratorio pone indicazione ad una valutazione specialistica (Consulenza Genetica).

Per un referto normale non vi è un colloquio post test ma l’esito viene illustrato dal clinico di riferimento che ha richiesto il test. In caso di positività il referto viene consegnato nell’ambito della consulenza genetica eseguita dal Direttore medico del Laboratorio presso il suo studio o in sede multidisciplinare (in collaborazione con il servizio di Genetica Clinica dell’Istituto).

Biobanca

Originariamente istituita presso il Laboratorio di Genetica Umana degli Ospedali Galliera di Genova nel 1983 con il nome ”Galliera Genetic Bank” nel 2019 è stata trasferita insieme al laboratorio presso l’IRCCS Istituto Gaslini dove ha acquisito l’attuale denominazione.

La biobanca è configurata come unità di servizio e opera in accordo a regolamenti e normative di nazionali ed internazionali, dal 2008 è certificata ISO 9001 e nel 2010 è stata formalmente riconosciuta dalla Regione Liguria come Biobanca per Diagnosi e Ricerca (delibera. N.34 del 22 Gennaio 2010).

Dal 2008 partecipa al Network Telethon di Biobanche Genetiche una rete nazionale che coordina, attraverso un’infrastruttura informatica comune, undici biobanche genetiche e condivide procedure operative e linee guida per gli aspetti legali, etici e qualitativi (http://biobanknetwork.telethon.it/). La Biobanca partecipa anche all’infrastruttura europea “Biobanking and Biomolecular Resources Research Infrastructure” (BBMRI) e dal 2012 fa parte della rete europea EuroBioBank http://www.eurobiobank.org/ ).

Ad oggi sono conservati quasi 12.000 campioni provenienti da circa 8.000 individui per un totale di circa 200 differenti difetti genetici.

Dal 2009 ad oggi la biobanca ha stipulato nell’ambito dell’attività del Network accordi specifici per fornire un servizio di biobanking a cinque Associazioni di pazienti (Associazione Internazionale Ring14; Nonsolo15 Onlus; Associazione Nazionale Mowat Wilson; Gruppo famiglie s.Dravet e Assigulliver) allo scopo di garantire che i campioni di loro interesse siano trattati secondo alti standard di qualità e di sicurezza, e che siano resi visibili nel web e disponibili a ricercatori nazionali e internazionali per specifici progetti di ricerca.

I principali servizi offerti dalla biobanca sono: allestimento di linee cellulari, estrazione di DNA e RNA, deposito, mantenimento e distribuzione dei campioni.

Per avere accesso ai servizi e per richiedere i campioni contattare: Dott.ssa Chiara Baldo e-mail: chiarabaldo@gaslini.org, tel. 010 5636 3954-3978.

I servizi della biobanca sono forniti nell’ambito del SSN nei casi con indicazioni di malattie rare e malattie genetiche tramite le impegnative per estrazione conservazione DNA e/o allestimento e conservazione linee cellulari. La GGB fornisce i suoi servizi anche per specifici progetti di ricerca finanziati da enti pubblici o privati (incluse le associazioni di pazienti) tramite accordi specifici. Dall’anno 2012 viene applicato un sistema di “cost recovery” limitatamente ai campioni distribuiti a scopo di ricerca. L’obiettivo del “cost-recovery” è quello di recuperare parzialmente i costi di distribuzione dei campioni, con lo scopo di garantire, seppure in minima parte, la sostenibilità della Biobanca stessa. Il listino dei costi è disponibile sul sito del Network (http://www.biobanknetwork.org/pricelist.php).

LINEE DI RICERCA

Titolo: Sviluppo di un modello cellulare in vitro per l’analisi molecolare di pazienti con Sindrome di Sotos e utilizzo di saRNA per la generazione di terapie innovative.

Descrizione: La sindrome di Sotos (SoS, OMIM#117550) è una malattia genetica rara la cui prevalenza è stimata in 1:14.000 nati vivi, si presenta con iperaccrescimento, macrocefalia e ritardo psicomotorio. E’ una condizione genetica autosomica dominante causata da aploinsufficenza dovuta a mutazioni nel gene NSD1 (proteina contenente il dominio SET di legame al recettore nucleare1). NSD1 è un fattore trascrizionale implicato nella regolazione di diversi geni essenziali per il differenziamento cellulare nello sviluppo embrionale ed espresso soprattutto a livello celebrale. Tuttavia, il meccanismo molecolare rimane in gran parte sconosciuto. Ad oggi, non ci sono specifiche terapie per la SoS, ma solo trattamenti diretti verso alcuni sintomi specifici.

Obiettivi

1) Studiare i profili di espressione genica in fibroblasti di pazienti con SoS e controlli

2) Caratterizzazione dei livelli di espressione e delle isoforme della proteina NSD1

3) Generazione e caratterizzazione di cellule staminali pluripotenti indotte (iPSCs) da pazienti e controlli e relativa conferma dell’espressione di NSD1

4) Differenziamento delle iPSCs in neuroni e conseguente identificazione di small activator RNA (saRNA) per correggere l’aploinsufficienza

Disegno sperimentale Il progetto sarà suddiviso in 3 fasi.

Fase 1: Verranno selezionati 15 pazienti affetti da SoS con mutazioni nel gene NSD1 e il rispettivo genitore sano dello stesso sesso come controllo. Sarà eseguita un’analisi di espressione genica mediante microarray su fibroblasti e/o cellule del sangue periferico mononucleate (PBMC) dei pazienti e controlli. Questo ci permetterà di valutare quali geni siano down o up regolati.

Fase 2: Generazione di linee iPSC a partire da fibroblasti e PBMC e conferma dei geni down o up regolati identificati in precedenza in fibroblasti dei pazienti SoS.

Fase 3: Le iPSCs verranno differenziate in cellule neuronali, allo scopo di individuare saRNA tessuto specifici per correggere l’aploinsufficienza.

Risultati attesi e rilevanza dello studio: Lo studio genererà 15 linee iPSCs derivate da pazienti affetti da SoS e controlli. L’analisi di espressione valuterà i pattern di geni differentemente regolati nei pazienti rispetto ai controlli per identificare i pathways molecolari in cui è coinvolto il gene NSD1. L’utilizzo di iPSCs sarà fondamentale per ottenere linee neuronali utili a individuare gli saRNA con l’intento di up regolare l’allele sano e ristabilire i normali livelli di espressione di NSD1 e mettere a punto terapie geniche innovative. La messa a punto di un sistema sinergico tra la biologia cellulare (standardizzazione del modello in vitro) e molecolare (saRNA) per lo sviluppo di terapie innovative, sarà utile non solo per la SoS ma anche per altre malattie genetiche causate da aploinsufficienza.

PRINCIPALI COLLABORAZIONI NAZIONALI ED INTERNAZIONALI

Antonello Mallamaci, Head, Lab of Cerebral Cortex Development, Neuroscience Area, SISSA, Trieste.
Luigi Mazzone, Department of Biomedicine and Prevention, University of Rome Tor Vergata, Via Montpellier 1, 00133 Rome, Italy.
European Molecular Quality Network EMQN (https://www.emqn.org/) Dott. Domenico Coviello, Board Member.